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农作物论文_水稻PMEI基因家族的全基因组鉴定与

来源:玉米科学 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-11-05
作者:网站采编
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摘要:文章摘要:果胶是植物细胞壁的主要组成成分之一,在种子形成、果实等器官发育中发挥着重要的作用。果胶甲酯酶(pectin methylesterase, PME)使果胶去甲酯化,而果胶甲酯酶抑制剂(p

文章摘要:果胶是植物细胞壁的主要组成成分之一,在种子形成、果实等器官发育中发挥着重要的作用。果胶甲酯酶(pectin methylesterase, PME)使果胶去甲酯化,而果胶甲酯酶抑制剂(pectin methylesterase inhibitor, PMEI)是通过调节PME去甲酯化活性,来共同调控果胶的甲酯化水平,从而调控植物果胶相关的生物学过程。水稻PMEI家族基因已经有过个别报道,但并没有进行过系统的生物信息学分析。本研究根据鉴定得到的49个水稻PMEI家族基因,利用单、双子叶植物的三个物种进行系统进化关系分析,结果表明水稻和玉米的PMEI基因之间同源性更高。对水稻PMEI进行结构特征域分析,表明大多数成员含有PMEI基因家族的特征结构域;利用RNA-Seq和微阵列数据进行分析,显示该基因在多个组织中表达,特别是在花药、雄蕊中有着较高的表达量,但在胚乳中几乎不表达;亚细胞定位预测表明,大部分PMEI基因存在于细胞膜中,在胞质、细胞核、质体、高尔基体、线粒体、过氧化物酶体等胞内位置也有分布,预示着PMEI功能的多样性。本研究通过对水稻PMEI基因家族的生物信息学分析,为进一步开展水稻PMEI基因家族的功能研究提供一定的参考依据。

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项目基金:《玉米科学》 网址: http://www.ymkxzz.cn/qikandaodu/2021/1105/1668.html



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